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注：东非线港口按照英文名称a~z顺序排列，可按首字母快速查找。
| 港口中文 | 港口英文 | 港口代码 | 所属国家 | 国家英文 | 所属航线 |
|---|---|---|---|---|---|
| 柏培拉 | berbera | SOBER | 索马里 | Somalia | 东非线 |
| 布兰太尔 | blantyre | MWBLA | 马拉维 | Malawi | 东非线 |
| 布琼布拉 | bujumbura | BIBUJ | 布隆迪 | Burundi | 东非线 |
| 达累斯萨拉姆 | dar es salaam | TZDAR | 坦桑尼亚 | Tanzania | 东非线 |
| 迪耶果苏瓦雷斯 | diego suarez | MGDIE | 马达加斯加 | Madagascar | 东非线 |
| 伊博 | ibo | MZIBO | 莫桑比克 | Mozambique | 东非线 |
| 朱巴 | juba | SSJUB | 南苏丹共和国 | South Sudan | 东非线 |
| 坎帕拉 | kampala | UGKAM | 乌干达 | Uganda | 东非线 |
| 基加利 | kigali | RWKIG | 卢旺达 | Rwanda | 东非线 |
| 基斯马尤 | kismayu | SOKIS | 索马里 | Somalia | 东非线 |
| 基特韦 | kitwe | ZMKIT | 赞比亚 | Zambia | 东非线 |
| 利隆圭 | lilongwe | MWLIL | 马拉维 | Malawi | 东非线 |
| 隆戈尼 | longoni | YTLON | 马约特 | Mayotte | 东非线 |
| 卢萨卡 | lusaka | ZMLUN | 赞比亚 | Zambia | 东非线 |
| 马任加 | mahajanga | MGMJG | 马达加斯加 | Madagascar | 东非线 |
| 摩加迪沙 | mogadishu | SOMGQ | 索马里 | Somalia | 东非线 |
| 蒙巴萨 | mombasa | KEMOM | 肯尼亚 | Kenya | 东非线 |
| 莫罗尼 | moroni | KMMOR | 科摩罗 | Comoros | 东非线 |
| 姆特瓦拉 | mtwara | TZMTW | 坦桑尼亚 | Tanzania | 东非线 |
| 摩加迪沙 | muqdisho | SOMOG | 索马里 | Somalia | 东非线 |
| 纳卡拉 | nacala | MZNAC | 莫桑比克 | Mozambique | 东非线 |
| 内罗毕 | nairobi | KENBO | 肯尼亚 | Kenya | 东非线 |
| 恩多拉 | ndola | ZMNDO | 赞比亚 | Zambia | 东非线 |
| 彭巴 | pemba | MZPEM | 莫桑比克 | Mozambique | 东非线 |
| 加莱角 | pointe des galets | REGAL | 留尼汪 | Reunion | 东非线 |
| 路易港 | port louis | MUPLU | 毛里求斯 | Mauritius | 东非线 |
| 克利马内 | quelimane | MZQUE | 莫桑比克 | Mozambique | 东非线 |
| 留尼汪 | reunion | REUNI | 留尼汪 | Reunion | 东非线 |
| 塔马塔夫 | tamatave | MGTAM | 马达加斯加 | Madagascar | 东非线 |
| 坦噶 | tanga | TZTAN | 坦桑尼亚 | Tanzania | 东非线 |
代表东非线港口中使用最频繁的港口。